تأسس نادي أتلتيكو مدريد عام 1903 من قبل مجموعة طلاب من الباسك يعيشون في مدريد.
رأى هؤلاء المؤسسون النادي الجديد على أنه أكاديمية شباب لفريق طفولتهم الذي عشقوه أتلتيك بلباو، وثم انضم لهم منشقون عام 1904 من نادي ريال مدريد لتزداد شعبية النادي في العاصمة الاسبانية ويأخذ طابعها.
أتلتيكو مدريد بدأ اللعب مرتدياً نفس الوان أتلتيك بلباو حتى قاموا بتغيير الوانهم عام 1911 للبحث عن قمصان أقل تكلفة!
أتلتيكو مدريد تم تسميته في البداية بأنه نادي أتلتيك – فرع مدريد، أي أنه تابع لبلباو، وبقيت حالة التبيعية هذه حتى عام 1921، ليصبح اسمه أتلتيكو مدريد ويستقل تماماً عن بلباو.